基因芯片技术的应用伴随着作用基因组学探索的深层次，迫切需要可以与此同时检测到很多目标基因的表达，迅速清晰地讲述了不一样生物组织或组织细胞在基因水准里的各种各样转录本的变化趋势(genechip)，又被称为dna微阵列（dnamicroarray)在这种情况下，技术性应时而生。阐述了基因分析历史的与应用。
2.生物学意义分析
主要指通过分析芯片杂交数据，研究差异表达基因的生物学意义。通常，在芯片中某一或发育时期可能有成千上万个差异表达基因。例如，表面---化方法，基因芯片分析植物根部可能有400多个特意表达的基因，金属表面---化，如果要将这些基因的来龙去脉都搞清楚，天津表面---化，可能要追溯超过4000篇以上的文献(假设1个基因需要查阅10篇文献)。这种不捡重点的方法耗时耗力，所获得的结果也往往没有意义。
将芯片与待研究的cdna或其他样品杂交，经过计算机扫描和数据处理，如何表面---化，便可以观察到成千上万个基因在不同组织或同-组织不同发育时期或不同生理条件下的表达调控情况。荧光标记的cdna与芯片上相匹配的dna序列发生杂交反应，是的芯片上的点呈现出荧光信号，荧光信号的强度和基因表达的多度呈正相关。基因芯片这种微型化装置具有---的容量，是科学家在单次试验中就可以分析整个基因组的变化。
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