在基片上制备微阵列(即高密度地固定生物分子于基片上)的过程是微阵列芯片的关键技术，台湾---化处理，发展非常迅速，相继出现了原位合成、预合成后钢针按触式点样、预合成后毛细管接触式点样、预合成后微泵喷涂等微阵列制备方法。这些方法在提高点样和点样效率、降低芯片成本等方面各有长有短。国际上一些大公司和研究机构，如biorobotics公司、cartesian公司、telechem interna-tional inc. standford大学和生物芯片北京工程研究中心等，---化处理方法，都在进行微阵列芯片的制备方法及制备系统的研发。 biorobotics 公司开发的芯片制备系统和telechem international inc 的微阵列制备工作头为各研究机构所普遍采用。
原位合成法主要为光引导聚合技术，它不仅可用于寡聚核苷酸的合成，---化处理公司，也可用于合成寡肽分子。光引导聚合技术是照相平板印刷技术（ photolithography ）与传统的---、多肽固相合成技术相结合的产物。半导体技术中曾使用照相平板技术法在半导体硅片上制作微型电子线路。固相合成技术是当前多肽、---人工合成中普遍使用的方法，技术成熟且已实现自动化。二者的结合为合成高密度---探针及短肽阵列提供了一条快捷的途径。
将芯片与待研究的cdna或其他样品杂交，经过计算机扫描和数据处理，便可以观察到成千上万个基因在不同组织或同-组织不同发育时期或不同生理条件下的表达调控情况。荧光标记的cdna与芯片上相匹配的dna序列发生杂交反应，是的芯片上的点呈现出荧光信号，荧光信号的强度和基因表达的多度呈正相关。基因芯片这种微型化装置具有---的容量，是科学家在单次试验中就可以分析整个基因组的变化。
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