目前， 在医学研究中 ， 数据分析方法在总体---为两大类:无监控集簇分析和有监控集簇分析。前者比较单纯的从数学角度按照基因表达的相似性将基因分组 ，香港表面---化， 这有助于发现新的目的基因或提供新的---信息 ， 如新的分型 、 影响预后的因素等。后者需要结合现有的知识进行分析，---化表面处理， 适用于---归类。这对于传统诊断手段是一个有益的补充。
另外， 在目前进行的许多微阵列芯片研究中，每次研究的基因数目很大 ， 而参与实验的样本量较少。这一现象不利于得到稳定的和具有---可重复性的实验结果。
主要原因是，合成反应每步产率比较低，不到 95% 。而通常固相合成反应每步的产率在 99% 以上。因此，探针的长度受到了---。而且由于每步去保护不很，表面---化过程，致使杂交信号比较模糊，信噪比降低。为此有人将光引导合成技术与半异体工业所用的光敏抗蚀技术相结合，以酸作为去保护剂，使每步产率增加到 98% 。原因是光敏抗蚀剂的解离对照度的依赖是非线性的，当照度达到特定的阈值以上保护剂就会解离。所以，该方法同时也解决了由于蔽光膜透光孔间距离缩小而基因芯片引起的光衍射问题，有效地提高了聚合点阵的密度。另据报导 ，利用波长更短的物质波如电子射线去除保护可使点阵密度达到 1010/cm2 。
基因芯片是一种中小型剖析设备，表面---化方法，能够迅速和准确地科学研究生物基因信息。制做基因芯片时，可以用机械手臂把很多已经知道或不明编码序列的dn---段点在玻璃镜片(一般为2cmx2cm)、铜片或尼龙膜上，再经物理吸附功效做到固定化(cdna芯片)。可以直接在金属板或金属表层开展有机合成，从而获得寡聚核糖核苷酸芯片。
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