按照芯片上的探针对微阵列芯片进行分类，有---芯片、蛋白质芯片和组织芯片等，目前应用泛的是---芯片，---芯片又有两种类型，---化处理的原理，分别是cdna微阵列和寡核苷酸微阵列。
cdna基因---由pcr产物组成，为双链结构，海南---化处理，长度一般在数百至数千碱基对，因而芯片的杂交条件对每个基因不能---是的，假阳性率较高，因此，判定cdna微阵列的终结果时，有---对筛选出的基因进行测序。在应用cdna微阵列进行研究时，一般需要提供一个对照样本，将其与需要研究的标本给予不同的标记，将二者灯亮混合后共同注入芯片进行孵育。扫描后得到的原始数据是各个单元格中信号强度的比率。
将芯片与待研究的cdna或其他样品杂交，---化处理的玻片，经过计算机扫描和数据处理，便可以观察到成千上万个基因在不同组织或同-组织不同发育时期或不同生理条件下的表达调控情况。荧光标记的cdna与芯片上相匹配的dna序列发生杂交反应，是的芯片上的点呈现出荧光信号，荧光信号的强度和基因表达的多度呈正相关。基因芯片这种微型化装置具有---的容量，是科学家在单次试验中就可以分析整个基因组的变化。
实际操作时需要注意的是，虽然共价偶联的方法优于物理吸附，但基于---和羧基的抗体固定方法仍具有一定程度的随机性，有时在fab区（用于结合抗原）存在易于修饰的---/羧基，在与固体表面偶联后会造成抗体的失活。在抗体领域，抗体与的偶联同样存在上面所说的问题（由于抗体表面可能存在很多可修饰的---酸，不能确定连在哪个部位
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