基因芯片技术由于同时将大量探针固定于支持物上，所以可以---对样品大量序列进行检测和分析，香港微阵列芯片，从而解决了传统---印迹杂交（southern blotting 和 northern blotting 等）技术操作繁杂、自动化程度低、操作序列数量少、检测效率低等不足。而且，通过设计不同的探针阵列、使用特定的分析方法可使该技术具有多种不同的应用价值，微阵列芯片制作，如基因表达谱测定、实变检测、多态性分析、基因组---作图及杂交测序等。
因此，生物学家和生物信息学家合作创立了将差异表达基因定位于不同的生物化学代谢途径的分析方法( pathway identification)。 统计每条生物化学代谢途径中固有的基因数量和被基因芯片定位的差异表达的基因数量，可以计算出特定或特定发育阶段表达有---差异的代谢途径。由于代谢途径通常负责执行生物体的重要功能，微阵列芯片检查，并且相对于原始数据，代谢途径的数量相对较少，可操作性强，已经成为目前学术界分析芯片技术数据的重要手段。
除了光引导原位合成技术外，有的公司如美国 incyte pharmaceuticals 等使用压电打印法 (piezoelectric printing) 进行原位合成。其装置与普通的彩色喷墨打印机并无两样，所用技术也是常规的固相合成方法。做法是将墨盒中的墨汁分别用四种碱基合成试剂所替代，微阵列芯片技术特点，支持物经过包被后，通过计算机控制喷墨打印机将特定种类的试剂喷洒到预定的区域上。冲洗、去保护、偶联等则同于一般的固相原位合成技术。如此类推，可以合成出长度为 40 到 50 个碱基的探针，每步产率也较前述方法为高，可达到 99% 以上。
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